Обустройство монастыря и подворья в XIX веке
С 1801 года новый игумен Иннокентий неутомимо заботился об улучшении внешнего быта братства, число которого постоянно умножалось. Он возвел восточную, западную и южную стороны внешнего каре монастырских строений, надвратную церковь в честь святых апостолов Петра и Павла, выстроил каменный странноприимный дом, а в 1823 году соорудил серебряную раку на месте, где почивают под спудом святые мощи преподобных Сергия и Германа.
В 1819 году монастырь посетил Император Александр I. Монахи были поражены его смирением. По возвращении в Петербург Император высоко отзывался о Валаамской обители, по его личному указу монастырь и был произведен в разряд первоклассных, что давало ему большие преимущества. Слава о благоустроенности обители стала распространяться не только по православной России, но и за ее пределами. Сюда приезжали даже из афонских монастырей. По внутренней духовной организации и устроению многие отдавали предпочтение Валаамской обители перед монастырями Афонской Горы.
В 1820 году в Петербурге, в Малой Коломне, на Мясной улице, был куплен для Валаамского подворья дом.
Обустройство монастыря продолжили: игумен Ионафан I (1823-1830 гг), игумен Варлаам (1830-1833 гг), игумен Вениамин (1833-1839 гг) и игумен Дамаскин.
Время правления игумена Дамаскина (1839-1881 гг) – целая эпоха в жизни монастыря, начало его внешнего процветания при высокой внутренней монашеской жизни. Архимандрит Игнатий Брянчанинов , как благочинный монастырей, оказывал ему всяческую поддержку. За это время был перестроен скит Всех святых, возведены новые каменные кельи, каменный храм, построена каменная двухэтажная гостиница в центральной усадьбе, каменный храм во имя Святителя Николая Чудотворца, двухэтажный дом для священнослужителей и братии с домовой церковью, новый деревянный храм во имя преподобного Александра Свирского, а также три деревянных келейных корпуса для братии на Святом острове, на острове Монашеском восстановили древнюю деревянную церковь и построили келии для братии.
В 1858 году обитель посетила царская семья. 28 июня два парохода "Стрельна" и "Александрия" подошли к монастырской пристани. Император Александр II с Императрицей Марией Александровной, сыновьями, в сопровождении сестры Государя, великой княгини Ольги Николаевны с супругом, сошли на берег.
В 1863 году игуменом Дамаскиным был построен трехэтажный водопроводный дом, в котором расположились мастерские и хозяйственные службы. В 1867 году на Ильинском острове был выстроен скит с деревянной церковью во имя святого пророка Илии и при ней – два деревянных двухэтажных дома. При своей пустыньке, в которую он уединялся до настоятельства, игумен построил в 1870 году небольшую деревянную церковь во имя Коневской иконы Божией Матери, а при ней – два деревянных келейных корпуса для братии. На юге Валаамского архипелага игуменом Дамаскиным была построена небольшая деревянная церковь с колокольней во имя преподобного Авраамия Ростовского и три деревянных кельи для жилья скитской братии. Тогда же, в 1873 году был отлит колокол в 1000 пудов на предполагавшуюся при новом соборе колокольню. На расстоянии одного километра к востоку от монастыря, в 1876 году возвели каменную церковь во имя Всех преподобных отцов, в подвиге просиявших, с отдельно стоящей колокольней. Здесь было устроено новое кладбище. Игумен Дамаскин заготавливал камни и кирпич для нового соборного храма, построить который Бог судил его преемнику игумену Ионафану.
Тщанием отца Дамаскина в разных местах острова возникло 18 часовень и поставлено 10 каменных и деревянных поклонных крестов. Господь посылал благодетелей, щедро жертвовавших на строительство и украшение обители. Игумена Дамаскина справедливо называют строителем Валаама.
При игумене Дамаскине значительно выросло число братии. Монастырь стал известен в России как один из наиболее благоустроенных. Игумен Дамаскин, как духовный отец, неусыпно заботился о спасении вверенной ему братии. Келья его всегда была открыта для посетителей. При столь обширном хозяйстве и строительстве игумен постоянно занимался с братией, часто исповедывал мирян и особенно принимал участие судьбах людей, падших нравственно, был к ним снисходителен, старался любовью наставить их на путь истинный. У него было много учеников из числа братии монастыря, которые впоследствии стали старцами, прославившимися многими благодатными дарами.
Игумен Ионафан II (1881-1891) продолжил благоустроение обители: были выстроены второй кирпичный, смоляной и кожевенный заводы, хлебный амбар и скотный двор с фермой и всеми службами. Для доставки из Петербурга необходимых для монастыря грузов построен корабль. Расчищены, осушены от болот и распаханы годные для посевов и покосов участки земли, монастырская библиотека пополнилась более чем на 1500 книг.
Но самым главным достижением в строительной деятельности игумена Ионафана II стал выстроенный им вчерне каменный Спасо-Преображенский собор с колокольней. Освящение закладного камня нового соборного храма на Валааме состоялось 30 июня 1887 года. На торжества прибыл президент Императорской Академии Художеств великий князь Владимир Александрович с супругой – великой княгиней Марией Павловной. Через 3 с половиной года трудами не только вольнонаемных рабочих, но и всей монастырской братии собор был возведен. Храм величественно вознес свои главы с крестами, когда дни игумена Ионафана были уже сочтены. 20 января 1891 года владыка скончался. Его могила, осеняемая гранитным крестом, находится за алтарем церкви на Игуменском кладбище, рядом с могилой игумена Дамаскина.
Одной из главных задач игумена Гавриила (1891-1903) стало завершение строительства нового Спасо-Преображенского собора, устройство иконостасов в нижнем и верхнем храмах, проведение живописных работ. В июне 1892 года в присутствии великого князя Владимира Александровича и супруги его великой княгини Марии Павловны, а также их детей – Бориса и Андрея, был освящен главный престол нижней церкви собора в честь преподобных Сергия и Германа Валаамских. А через год освящен боковой придел нижней церкви во имя Благовещения Пресвятой Богородицы. Верхняя церковь во имя Преображения Господня освящена в июне 1896 года в присутствии членов императорской семьи – великого князя Владимира Александровича с супругой и великого князя Кирилла Владимировича с великой княгиней Марией Александровной. Собор производил неизгладимое впечатление на всех, кто его посещал.
За время двенадцатилетнего настоятельства отца Гавриила были построены каменные церкви островных скитов: в Тихвинском скиту во имя Тихвинской иконы Божией Матери (1899); в Сергиевском во имя преподобных Сергия и Германа Валаамских (1899); в Германовском заложен храм в честь святого благоверного князя Александра Невского (1901). На Валааме в местечке Никоново, где раньше находилась часовня святого апостола Андрея Первозванного, был заложен храм в честь Воскресения Христова (1902). В монастырской усадьбе надстроен третий этаж юго-западного братского корпуса внешнего каре и зимней гостиницы. В Москве в 1901 году стараниями купцов Прусаковых и Курниковых было выстроено двухэтажное подворье монастыря.
При игумене Гаврииле Валаамский монастырь стал школой воспитания и духовного становления будущих настоятелей русских монастырей.
При игумене Гаврииле впервые за всю историю обители была осуществлена запись на ноты богослужебных песнопений, до этого времени сохранявшихся в устной церковно-певческой валаамской традиции. В 1903 году вышел в свет "Обиход Валаамского пения". При отце Гаврииле не только расширялось строительство монастыря, но и значительно умножилась братия – с четырехсот человек до тысячи. Для насельников игумен Гавриил являлся духовным отцом, старавшимся исправлять провинившегося брата духом кротости и любви. "Без любви нельзя построить ничего, заслуживающего благодарности, – Часто повторял он. – Если руководитель не любит братию, то и братия не будет уважать друг друга, и отсюда последует только внешнее соблюдение Устава и напрасные поиски духа и милости".